洁净工作台的结构与类型紧密相关，把组成洁净工作台的各主要部件进行不同的排列， 就得到不同形式的洁净工作台，服务于不同的用途。不管是哪种形式的洁净工作台，都是由 风机、高效过滤器、粗效过滤器、壳体、台面、紫外线灯（进行起始前或终了后的灭菌）、照明灯、调压器、压差显示表等部件组成的。
1.水平平行流洁净工作台，有隔板的高效过滤器大多采用150mm的厚度，无隔板的高效过滤器厚度大多小于100mm，从结构上可以看出，采用无隔板高效过滤器可使洁净工作台的宽度尺寸减小，便于搬运。洁净工作台有的装设离心风机，有的装设三点支承式的离心风机组，前者在双人水平流洁净工作台中多用，而后者多用于单人洁净工作台，如图（2）所示，若用于双人洁净工作台，需装设两台离心风机组，噪声较高。双人水平平行流洁净工作合与单人水平平行流洁净工作台的区别在于工作台的长度不同，前者用于两人同时操作，后者用于单人操作。
水平平行流洁净工作台由于前面无玻璃遮挡，所以操作方便，还可使用较大的仪器如显微镜，在医院生殖中心或营养液配制间多用此型工作台。但当使用完毕，由于前面无遮挡而容易被污染，再次使用前的擦洗工作量大（特别是在非无尘车间使用）。这种洁净工作台洁净气流水平吹向操作人员，当操作对象产生对人体有害的微粒时，不应采用该形式的工作台。 图（1）所示的形式，都是洁净气流与室内空气进行交换的形式。也就是说，工作台的风机吸入的是经粗效过滤后的室内空气，再经高效过滤后送出，故洁净工作台宜在无尘车间内使用。
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